正磷酸是由一个单一的磷氧四面体构成的磷酸。在磷酸分子中P原子是sp杂化的，3个杂化轨道与氧原子间形成3个σ键，另一个P—O键是由一个从磷到氧的σ配键和两个由氧到磷的d-pπ键组成的。σ配键是磷原子上的一对孤对电子向氧原子的空轨道配位而形成。d←p配键是氧原子的py、pz轨道上的两对孤对电子和磷原子的dxz、dyz空轨道重叠而成。由于磷原子3d能级比氧原子的2p能级能量高很多，组成的分子轨道不是很有效的，所以P—O键从数目上来看是三重键，但从键能和键长来看是介于单键和双键之间。这可能是磷酸浓溶液之所以粘稠的原因。
1） 除氟和硅： 湿法磷酸中的氟， 通常以SiF6形式存在， 工业生产常加入钠盐 （例如NaCl）或者钾盐，与之形成难溶的Na2SiF6或K2SiF6沉淀，经过滤分离即可除去氟和硅。
2） 除硫酸根：加入钙盐（要求不高时）或钡盐（要求较高时） ，与之形成难溶的CaSO4或 BaSO4沉淀，经过滤分离即可除去。
3） 除铁、铝、镁：加入碱性物（例如Na2CO3、NH3等）与湿法磷酸进行部分中和（PH ＝2.5～3.0） ，形成一系列非水溶性铁、铝、镁磷酸盐的复杂化合物，经过滤分离即可除 去。
P2O5和冷水生成偏磷酸,热水是磷酸. 磷酸与 AgNO3 产生黄色沉淀，偏磷酸产生白色沉淀。但只有偏磷酸能使蛋白水溶液凝聚产生白色沉淀。磷酸主要用于制药、食品、肥料等工业，包括作为防锈剂，食品添加剂，和矫形，EDIC腐蚀剂，电解质，助焊剂，分散剂，工业腐蚀剂，肥料的原料和组件家居清洁产品。也可用作化学试剂，磷酸盐是所有生命形式的营养。85％磷酸是无色透明或略带浅色、稠状液体，易熔点42.35℃，沸点213℃时（失去1／2H2O），则生成焦磷酸，加热至300℃变成偏磷酸，易溶液于水，溶于乙醇，其酸性较硫酸、盐酸和酸弱，较醋酸、硼酸强，浓磷酸在瓷器中加热时有侵蚀作用。
1 农业：种植田作物需要的磷肥就是以磷酸为原材料生产的，磷肥里面包含过磷酸钙、磷酸二氢钾等物质，生产饲料所需的营养剂磷酸二氢钙也是以磷酸为原材料配置而成。
2 工业：磷酸在化工领域也占据一定的地位，属于一种化工原料。工业磷酸可以清理金属表面一些难溶的磷酸盐薄膜，可以避免金属遭到腐蚀，起保护作用；工业磷酸与酸混合后可以制成化学抛光剂，可以提高金属性能；工业磷酸还可用作虫剂的原料磷酸以及洗涤用品；工业磷酸可以作为生产含磷阻燃剂的原料。
3 医学：含磷可以通过磷酸制取，甘油磷酸钠就是由磷酸配置而成。
4 食品：磷酸可以作为食品添加剂，除此之外还可用作营养增强剂，包括酵母营养剂、酸味剂等。