清刷洁净后方可进行消毒。清洗消毒人员用配好的消毒液对水箱内壁自上而下、由里向外，均匀喷涂在内壁表面。喷涂完后清洗消毒人员退出水箱，盖上孔盖。消毒剂在调配和使用时要严格按照产品使用说明及配比要求进行。30分钟后打开进水阀，排空消毒液，然后再使用自来水对水箱进行反复清洗，不留死角。清洗消毒后，要清理好所有设备、工具和物品，不能遗留在水箱内。
箱清洗目的保证供水清洁卫生，符合卫生检验标准。适用范围水池、水箱的清洗、消毒，阀门、浮球阀的检修。内容每年对地下水池清洗二次，对天面水箱清洗二次，若遇特殊需要可增加清洗次数。清洗后，由清洗单位取水样送市防疫站化验取证，使水质达到国家卫生饮用水的标准。清洗工作由取得合格证的人员执行，清洗人员要有健康合格证。清洗前的准备工作。清洗人员应准备好所需的机电工具、清洗工具、消毒工具。根据清洗时间安排，报管理处主任审批停水时间。清洗周应出通告通知客户停水时间，以便客户做好贮水准备。
在清洗不锈钢水箱的过程中，消毒人员须带护眼镜、口罩，如在水箱内感到身体不适，产生头晕、眼睛酸痛、心闷、气紧，要马上离开水池，用清水冲洗眼睛，呼吸新鲜空气即可恢复。除杂物和清池时，先用铁铲铲出池内泥砂及各种沉积物，然后用扫把或尼龙刷从水池(箱)的顶部——四周墙壁——水池(箱)底顺序，依次反复刷洗。刷洗完毕用高压水枪整体冲洗一遍，排出污水。